Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BARHL1Q9BZE3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms