Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN1Q9BY11 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN1Q9BY11 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN1Q9BY11 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN1Q9BY11 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms