Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms