Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms