Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms