Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHF23Q9BUL5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF23Q9BUL5 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms