Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB6Q9BUF5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms