Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRDL1Q9BU40 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRDL1Q9BU40 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms