Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms