Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms