Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGIP1Q9BQI5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms