Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms