Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms