Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms