Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NOTCH4Q99466 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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