Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMNAT3Q96T66 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMNAT3Q96T66 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms