Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTAGE1Q96RT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms