Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNT1Q96Q11 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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