Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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C2orf48Q96LS8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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C2orf48Q96LS8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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C2orf48Q96LS8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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C2orf48Q96LS8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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C2orf48Q96LS8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C2orf48Q96LS8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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