Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms