Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms