Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CELF6Q96J87 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms