Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF2Q96GP6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms