Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms