Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALSU1Q96EH3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms