Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CMTM5Q96DZ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CMTM5Q96DZ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms