Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms