Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms