Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms