Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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