Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms