Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAVIN3Q969G5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms