Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms