Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIFAP3Q92845 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms