Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms