Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX33Q8WV41 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX33Q8WV41 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms