Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms