Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX54Q8TDD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms