Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms