Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TMIEQ8NEW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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