Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSNK2A3Q8NEV1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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