Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms