Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD53Q8N9V6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms