Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC89Q8N998 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms