Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms