Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms