Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms