Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRX1Q86UT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRX1Q86UT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms