Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC1Q7Z7K0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMC1Q7Z7K0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms