Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT28Q7Z3Y7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms